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16S+ITS測序的原理和用途

更新時間:2021-09-01      點擊次數(shù):2617
  16S+ITS測序是對特定長度的PCR產(chǎn)物或者捕獲的片段進行測序,目前主要是應(yīng)用高通量測序技術(shù)對特定環(huán)境中特定遺傳物質(zhì)進行測序。大多數(shù)天然微生物都不能通過傳統(tǒng)的分離培養(yǎng)方法進行分離和克隆,這對于天然微生物定性和定量,探索微生物多樣性是嚴(yán)重的挑戰(zhàn)。擴增子測序可以克服傳統(tǒng)分離培養(yǎng)的弱點,對樣品中的微生物進行定性和定量,目前在微生物多樣性檢測中廣泛應(yīng)用。
  16S+ITS測序的原理和用途:
  16SrDNA測序:16SrDNA是編碼16SrRNA的基因,存在于所有細(xì)菌基因組。其既能體現(xiàn)不同菌屬之間的差異,又能利用測序技術(shù)較容易地得到其序列,目前被廣泛用于病原菌的檢測和鑒定。它的可變區(qū)經(jīng)常用于不同微生物群落的屬或種系統(tǒng)進化分類。
  ITS測序:在真核生物中,18SrDNA和28SrDNA轉(zhuǎn)錄間隔序列稱為ITS區(qū)。由于其是非轉(zhuǎn)錄區(qū),承受的選擇壓力較小,變異強;屬于中度保守區(qū)域,利用它可研究種及種以下的分類階元。
  16S+ITS測序技術(shù)優(yōu)勢:
  較低的成本:與宏基因組測序相比,對測序深度的要求更低,性價比較高;
  鑒定效率高:與克隆或培養(yǎng)等傳統(tǒng)鑒定方法相比,微生物群16S/ITS測序是一種更快、更準(zhǔn)確的方法。
  高靈敏度:可以鑒定出豐度極低的細(xì)菌。
  雙區(qū)檢測:針對一個或多個可變區(qū)域的靈活性,能夠進行更長的序列讀取,并能夠?qū)溥M行更準(zhǔn)確的分析。

16S+ITS測序

 

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